日本確定申告首先要區分「是否需要提交所得稅確定申告」和「是否可能涉及住民稅的地方手續」。例如，已年末調整的上班族並非一律要申報；但全年薪資超過2,000萬日圓，或符合「其他所得超過20萬日圓」等條件時，通常需要辦理所得稅確定申告（-）。外國人的海外收入也不能只按國籍判斷，應先確認其在日本稅法上的居住者或非居住者身分。
先確認是否需要辦理所得稅確定申告
本節所說的日本所得稅確定申告，僅指個人所得稅手續。國稅廳列舉的相關對象包括個人事業經營者、取得薪資所得者，以及有股票、土地或建築物等轉讓所得的個人。上班族不能只憑「是否有副業」判斷，先按薪資來源和年末調整情況核對。
| 自查項目 | 符合時的判斷 |
|---|---|
| 全年薪資收入 | 超過2,000萬日圓的上班族，需要辦理確定申告。 |
| 僅有一處雇主 | 薪資已全部源泉徵收時，扣除薪資所得和退休所得後的其他所得合計超過20萬日圓，需要申報。 |
| 有兩處以上雇主 | 未做年末調整的薪資金額與其他所得合計超過20萬日圓時，原則上需要申報。 |
| 兩處薪資的例外 | 薪資總收入扣除雜損、醫療、捐贈及基本扣除後的餘額不超過150萬日圓，且其他所得合計不超過20萬日圓的，可不申報。 |
例如，某上班族全年只從一家公司領薪資，且該薪資已全部源泉徵收；其是否需要辦理所得稅確定申告，應看薪資及退休所得以外的其他所得合計是否超過20萬日圓。未超過該金額，並不等於所有人或所有稅務事項都當然無需處理。
多數上班族可透過雇主的年末調整完成所得稅結算；但只要落入上表任一條件，就應依個人實際收入情況繼續確認申報義務。
確認申報年度、期限與錯過期限後的處理
先按收入發生的年度選擇對應的申報書。例如，國稅廳會分別提供「令和7年分」「令和8年分」等年度的申報資料、專題說明及功能資訊；不要因網頁顯示最新年度，就誤用不屬於自己申報年度的表格。
| 事項 | 應確認的時間規則 |
|---|---|
| 一般確定申告 | 國稅廳總覽會隨年度更新，但該總覽頁本身未列出具體截止日。辦理時應以申報年度的當期公告為準。 |
| 還付申告 | 適用於原本無需一般申告、但已預扣或預納稅額高於全年應納稅額的情形。原則上可自該年度翌年1月1日起5年內提出。 |
| 適用特例時 | 如適用藍色申報特別扣除等特例，不能僅按還付申告的5年期限判斷，須在法定申告期限前提交。 |
還付申告常見於中途離職而未完成年末調整，或因醫療費、捐贈、雜損及符合條件的住宅相關扣除而可能產生退稅的情況。是否可退，應以全年所得計算後的稅額與已預扣、預納稅額比較；源泉徵收票相關欄位為「0」時，不會產生退稅額。
錯過確定申告期限怎麼辦，應先查看當年度國稅廳公告並儘快確認可提交方式。若因疾病、災害等正當理由無法按期辦理，是否可申請延長也應按當期規定個別確認。
外國人如何判斷稅務身分與海外收入問題
外國人稅務申報不能只看國籍或在留資格。就日本國內法而言，個人在日本有住所，或連續擁有居所滿1年以上，屬於「居住者」；不符合這些條件的個人屬於「非居住者」。此一分類用於判斷源泉所得稅及所得稅相關的納稅義務。 相關閱讀：初到日本者的稅務申報指南。
先判斷身分，再確認所得範圍
- 確認是否有住所：「住所」指生活本據，即生活中心所在地，應根據客觀事實判斷；必要時也可能參考職業等情況。
- 確認居所持續時間：「居所」是實際居住、但並非生活中心的地點。連續擁有居所滿1年以上時，也屬於居住者。
- 再處理海外收入：本資料未提供居住者與非居住者的海外收入計入範圍、申報方法等完整規則，因此不能僅憑身分類別斷言外國人海外收入一定需要申報或一定無需申報。
例如，持外國國籍、但在日本已形成生活本據的人，應先按上述標準確認身分，而不是以國籍直接判斷。若同時適用日本與其他國家或地區的租稅條約，居住者判定可能與國內法不同，應透過國稅諮詢窗口或結合個案進一步確認。
此外，日本所得稅的確定申告結論不等於地方稅手續已經完成。住民稅屬於地方稅事項，具體處理可能因都道府縣、市區町村而異，需另向所在地自治體確認。
按收入和扣除項目準備申報資料
確定申告資料應按本人收入和擬申報的扣除項目分別整理，並非每種文件都人人必需。先備好申告書本冊，再按適用情形補充所得、扣除及經營資料；如涉及退稅或繳款，可同時準備銀行帳戶資訊。紙本申報書需本人簽名或蓋章，電子申報則須完成認證。 相關閱讀：更換工作時所得稅申報注意事項。
| 情形 | 可準備的主要資料 |
|---|---|
| 薪資收入 | 給与所得の源泉徴収票（薪資所得源泉徵收票）。 |
| 保險或捐贈扣除 | 生命保險費、地震保險費、捐贈等對應的扣除證明書。地方團體捐贈時，可用特定事業者出具的「寄附金控除に関する証明書」替代捐贈收據。 |
| 個體經營 | 按規定保存的記帳、帳簿等資料。藍色申報還應準備決算報告表和資產負債表；白色申報則準備收入金額及必要經費明細。 |
| 住宅貸款扣除 | 適用年末餘額調書方式的相關資料。 |
例如，有薪資收入並申報保險費、捐贈扣除的人，可將源泉徵收票與相應扣除證明書配套整理；不應把僅適用於其他所得類型的附表一併視為必交文件。
如為還付申告，基本文件是確定申告書。存在土地、建築物或股票等分離課稅轉讓所得時，需加附第三表；擬將當年損失結轉至以後年度時，需加附第四表。其他附件應以當年《所得稅及復興特別所得稅的手引》和個人所得類別核對。
日本確定申告的完整辦理步驟
完成申報資格與資料整理後，可按以下順序在國稅廳線上工具中製作和提交。確定申告書等作成コーナー支援依螢幕指引輸入金額，在家製作申告書，並自動產生所需附表和明細書。
- 進入製作入口：選擇「作成開始」，新增申告書、決算書或收支內訳書。
- 輸入並製作：依頁面項目填寫相關金額；如曾儲存過申報資料，可讀取.data格式檔案繼續編輯或重複使用。
- 彙總與核對：如需整理醫療費支出內容或配當收入等資料，可下載系統提供的集計用檔案，在試算表軟體中彙總後再核對申告內容。
- 提交後留存：提交完成後，可透過e-Tax下載.xtx格式檔案核對申告內容，並儲存該檔案作為本次網路報稅流程的紀錄。
製作過程中應以系統頁面顯示的項目為準；需要繼續修改時，可利用已儲存的資料重新進入製作頁面處理。
如何使用e-Tax線上製作和提交
使用e-Tax線上報稅時，可從國稅廳電子申告・納稅系統進入。系統支援以公的個人認證服務登入，也可經マイナポータル進入；官網提供「使用流程」、操作手冊和常見問題，適合先確認自己的登入方式與操作環境。
e-Tax前置條件與功能
- My Number Card方式：準備含電子證書的マイナンバーカード，以及辦卡時自行設定的兩種密碼。使用平板或電腦時，還需能夠讀取卡片的手機或IC卡讀卡機。
- マイナポータル連携：持卡人可透過連動功能，自動取得薪資所得源泉徵收票及部分扣除證明資料，並填入申報表。國稅廳也提供手機、電腦申報手冊。
- 提交前核對：自動帶入是可使用的功能，並不代表所有資料都會填入。仍應逐項核對系統顯示內容與本人持有的證明資料；部分資料可按系統要求以影像資料提交。
例如，持有マイナンバーカード的個人可先透過マイナポータル連動取得可取得的資料，再補充未自動帶入的項目，並核對後完成線上提交。
e-Tax除維護時間外提供服務，但可用時段會因業務而異：部分服務可在0:00至24:00使用，部分則為8:30至24:00。計畫線上報稅時，應在操作當天確認對應功能是否開放。
副業20萬日圓、繳稅與退稅：常見誤解
「副業20萬日圓」不能按收入名稱機械判斷
「副業不到20萬日圓就不用處理」並不是可直接套用的結論。國稅廳在計算「其他所得金額合計」的20萬日圓門檻時，列有若干不計入項目，包括選擇不申報的部分上市股票股利、特定帳戶內選擇不申報的股票轉讓所得、特定公社債利息，以及屬於源泉分離課稅的部分利息和金融類似商品收益等。
因此，應先確認每筆收入的所得類別及是否屬於可選擇不申報的項目，不能只把所有被稱為「副業」的收入直接相加。關於繳稅，國稅廳總覽頁未明確列出申報手續費或稅務署審核處理時長，不宜據此自行推斷費用或入帳時間。
可能退稅時如何提交或更正
| 事項 | 可採取的手續 |
|---|---|
| 提交還付申告 | 可在國稅廳「確定申告書等作成コーナー」輸入金額並線上提交；也可向申報時納稅地所管轄的稅務署提交。 |
| 已申報但少報退稅額 | 原則上可自提交還付申告書之日起5年內提出「更正請求」。 |
線上製作時，系統會自動產生所需附表和明細書；線下辦理則應向本人納稅地所管轄的稅務署提交。若退稅金額可能有遺漏，先核對已提交內容，再判斷是否提出更正請求。
